Vào tháng 12 năm 2019, chủng virut mới SARS-CoV-2 (tên ban đầu 2019-nCoV hoặc thường được đặt gọi là coronavirus) đã được xác định tại Vũ Hán, thủ phủ của tỉnh Hồ Bắc, Trung Quốc. Các quan sát cho thấy virus có khả năng lây lan từ người sang người và gây ra COVID-19 – một bệnh hô hấp cấp tính với thời gian ủ bệnh ước tính trong khoảng từ 2 đến 14 ngày.
Dựa trên sự lây lan nhanh chóng của nó với hơn 87.000 trường hợp được xác nhận vào đầu tháng 3 năm 2020, Tổ chức Y tế Thế giới đã tuyên bố dịch bệnh là một trường hợp khẩn cấp về sức khỏe cộng đồng đang được quốc tế quan tâm (nguồn https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019.
Thông tin cơ bản về SARS-CoV-2:
■ Có quan hệ với SARS-CoV và MERS-CoV
■ Phát hiện dựa trên kỹ thuật PCR
Thử nghiệm thực hiện đối với:
■ Những người có triệu chứng đã tiếp xúc với những người được xác nhận COVID-19
■ Kết quả âm tính mặc dù có nghi ngờ nhiễm trùng mạnh cần lấy lại mẫu và phân tích PCR
Quy trình phát hiện
Analytik Jena đề xuất quy trình làm việc hoàn chỉnh từ khi lấy mẫu cho đến khi phát hiện ra virus.
1. Chuẩn bị mẫu:
- Mẫu từ đường hô hấp: Dịch phết mũi họng và hầu họng (bằng tăm bông tiệt trùng) ở bệnh nhân cấp cứu và đờm (nếu có) và hoặc dịch rửa nội soi phế quản ở bệnh nhân bị triệu chứng hô hấp nặng hơn.
- Huyết thanh để xét nghiệm huyết thanh học, mẫu bệnh nhân bắt đầu biểu hiện (acute sample) và mẫu bệnh nhân trong quá trình hồi phục dưỡng bệnh (convalescent sample) (đây là mẫu bổ sung cho mẫu từ đường hô hấp và có thể hỗ trợ xác định tác nhân thực sự, khi đã có xét nghiệm huyết thanh học).
2. Tách chiết (Ly trích) Acid nucleic
Analytik Jena cung cấp nhiều lựa chọn thiết bị và bộ hóa chất để tách chiết RNA virus từ dịch phết, dịch cơ thể không có tế bào (ví dụ như huyết thanh, huyết tương) và mẫu khác. Dòng sản phẩm innuPREP AniPath cho phép trích xuất đồng thời DNA và/hoặc RNA của vi khuẩn và virus từ mẫu tương ứng. Tổng quan các sản phẩm được hiển thị trong bảng dưới đây:
3. Khuếch đại và phát hiện
Các xét nghiệm phân tử để phát hiện SARS-CoV-2 đã được phát triển và có thể truy cập thông tin trên trang chủ của WHO (https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/ laboratory-guidance) . Một số bộ hóa chất thương mại dựa trên real-time PCR cũng đã có sẵn trên thị trường.
Quá trình pha trộn (mix) phản ứng PCR có thể được thực hiện với thiết bị Liquid Handling CyBio FeliX. Sử dụng tủ thao tác PCR đảm bảo an toàn tối đa, giảm nguy cơ nhiễm hoặc tủ PCR cung cấp sự an toàn tối đa và giảm thiểu rủi ro ô nhiễm. Các thành phần của phản ứng phiên mã ngược và phản ứng PCR được cung cấp bởi Analytik Jena. Mọi xét nghiệm real-time PCR đều có thể thực hiện trên máy real-time qTower3.
Công ty TNHH Thiết bị 2H cung cấp giải pháp toàn diện cho các xét nghiệm phân tử từ thiết bị tới hóa chất:
■ Thiết bị:
– Thiết bị tách chiết acid nucleic: InnuPure C16 touch (Lên tới 16 mẫu/ 31-84 phút), CyBio FeliX (Lên tới 96 mẫu / 62 – 73 phút)
– Thiết bị liquid handling: pha trộn (mix) phản ứng PCR tự động: CyBio FeliX
– Thiết bị PCR, Điện di, chụp ảnh gel: Biometra Tadvaced
– Thiết bị real-time PCR: qTOWER3
■ Hóa chất
– Kit tách tách chiết acid nucleic tự động và bằng tay: innuPREP Virus DNA/RNA Kit, innuPREP AniPath DNA/RNA Kit – IPC16
– innuPREP Virus RNA Kit
– Hóa chất PCR, phiên mã ngược